消滅ってのがどこからも消し去るんじゃなくて
世界のある次元からまどかのいる次元に引っこ抜く形だからじゃね？
まどかと同じ方法で上位になりました、じゃあ確かに不自然だけど、
まどかの力で（自力で上位になったまどかとは別ルートで）上位になりました、なら不自然は無いだろう

男にも興味が無いは無いでしょ、ほむら結界内でも悪魔ほむら改変後でも通じて恭介大事にしてるし
本編の記憶があって暗躍しなきゃいけないポジだからあの振る舞いじゃなきゃむしろおかしい

まどかは過去も未来も見えるとは言ったけど、世界の時間軸を超越してるだけでまどか自身は自身の時間軸を持ってる
正にその話の後に"みんな"を迎えに行ってるから