受賞歴（順次追加）※特記なきものは作品の受賞

■広島国際映画祭（2016年新設）
ヒロシマ平和映画賞
■第38回ヨコハマ映画祭
作品賞
審査員特別賞（のん）
■第31回高崎映画祭
ホリゾント賞（片渕須直監督、のん）
■2016年第90回キネマ旬報ベスト・テン
日本映画ベスト・テン 1位
日本映画監督賞（片渕須直監督）
読者選出 日本映画ベスト・テン 1位
読者選出 日本映画監督賞（片渕須直監督）
■第40回日本アカデミー賞
最優秀アニメーション作品賞
優秀音楽賞（コトリンゴ）
■第71回毎日映画コンクール
日本映画優秀賞
大藤信郎賞
音楽賞（コトリンゴ）
■第26回東京スポーツ映画大賞
作品賞
■第59回ブルーリボン賞
監督賞（片渕須直監督）
■おおさかシネマフェスティバル2017
2016年度ベストテン 1位
音楽賞（コトリンゴ）
■第22回 AMD Award '16
優秀賞
■平成28年度（第67回）芸術選奨
文部科学大臣賞（片渕須直監督）
■フランス アヌシー国際アニメ映画祭
長編部門 審査員賞

■その他
Filmarks 2016年公開満足度ランキング：1位
スペイン ナバラアニメ映画祭2017：観客賞
映画秘宝 2016年度：ベストテン 2位、ベストガール（のん）
eAT金沢2017：金沢大賞（片渕須直監督）
映画芸術 2016年：ベストテン 1位
ぴあ 2016年初日満足度ランキング：1位
Best 10 Cinemas in Sapporo 2016：日本映画 1位、監督賞（片渕須直監督）、アニメーション賞、特別賞（のん）
日本インターネット映画大賞2016年度：作品賞1位、アニメ賞、監督賞（片渕須直監督）、思い入れ映画賞、最優秀女優賞（のん）、ベストインパクト賞（片渕須直監督、のん）
2016年度全国映連賞：作品賞、監督賞（片渕須直監督）、女優賞（のん）
第11回声優アワード：助演女優賞（潘めぐみ）、特別賞（のん）
第41回日本カトリック映画賞
第36回藤本賞：特別賞（丸山正雄、真木太郎）
第34回日本映画復興賞：日本映画平和賞
第59回児童福祉文化賞：映像・メディア等部門
文化庁長官表彰 国際芸術部門（片渕須直監督）
宮崎映画祭 2017年 金のはにわ賞：アニメーション賞
2016年度 第16回Sense of Gender賞：時を超える賞