一応あのゴルバ内のアンドロメダ級の映像がフェイクだった(マザーデザリアムとかのでっち上げ)という線でも筋は通るかなと。
あの映像自体は一部の人間(藤堂や芹沢達、一部のヤマトクルー)しか知らないから、彼等が地球での影響力が弱くなった今の時点ではそんなに問題じゃない。いざとなれば重核子爆弾で地球人類を無力化or洗脳できるし。
むしろヤマトに見せる為に作った可能性も高い。あの映像がフェイクにしろ、ただ「私たちは未来から来た地球人類です」とかいう突拍子もない発言とあの年表を裏付ける証拠になっちゃってるからヤマトは銀河の中心に向かってる訳で。
ヤマトがデザリアムの地球占領にとって厄介なのは間違いなく、そのヤマトを遠ざけることに役立ってるしメリットはあると思う。(ただ、ヤマトのCRSが必要らしいんで追っかけることにはなりそうだが)