ドラえもん映画で最強の敵とかランキングするのも野暮だとは思うが　
・ポセイドン。
鬼角弾(要は核ミサイル)発射で核戦争を引き起こし地球を死の星に変えてしまう
・無限に湧いてくる鉄人兵団。
戦って勝てないからタイムマシンで博士に頼んで消してもらうしかなかった

このあたりか？他にあったら求む