うーん、なんかイマイチ信じがたい話ではあるな。
マジックメソッドについてはクラスのメタデータキャッシュして2回目以降の呼び出しは速いはずだし。
例えばDoctrineはアノテーション使ってるし遅くなる要因はこっちの方が大きそう。
そもそもマッピングは枯れた技術ではあるので遅いなら他のフレームワーク参考にして同程度まで速度改善できるず。
フレームワーク全体で遅いなら理解できるけどORM単体でそんなに差がでるとは思えないな。クエリが遅いとかなら理解できるけど。