ふつうに純正品または互換カートを買う使い方ならエプソンがいい

詰め替えや連続供給化など改造ベースとしての視点ならば、
残量検知を簡単に無効化できる観点で、間違いなくキヤノン

給紙性能はキヤノンのほうが上。
エプソンは給紙ミスが昔から多い。光沢用紙を正常に装填しても給紙に失敗する。
不満が出ても改善されない。

キヤノンは純正品のみで大事に使ってても突然死（電源入らない、or B200）する。
純正インクだけ使っててもヘッドが焼き切れる。
ヘッドが壊れても単体で購入できない。壊れたら通常の手段では修理できない。
上のような得体のしれないヘッドを購入して延命させることができる。

エプソンはヘッドの取り外し自体が極めて困難。
配管内に気泡が一度でも入ると取り除くのが困難。
壊れた時にユーザー側でやれることがキヤノンより少ない。

自分の印刷したい目的と、自己修理の技術レベルがあるのかないのかで
トータルで考えてメーカーを決めればよい。